AVIRON – Inférence amortie et réalité virtuelle pour segmenter de grands volumes de données neuronales

Il existe actuellement un effort mondial pour comprendre le système nerveux et le fonctionnement “algorithmique” du cerveau. Les progrès de la microscopie permettent désormais d’obtenir des images de grandes sections de données neuronales chez des animaux actifs. Une tâche nécessaire est l’extraction des connectomes neuronaux locaux et globaux pour déchiffrer l’émergence des capacités de calcul et de cognition au sein de ces architectures. Pour relever ce défi, le projet introduit une approche logicielle innovante, AVIRON, qui combine la réalité virtuelle (VR), la cognition humaine et les procédures d’inférence pour permettre un traçage et une segmentation rapides de grands volumes d’images neuronales. Nous développerons un logiciel fondé sur notre plateforme DIVA actuelle pour : (i) intégrer n’importe quelle pile d’images en VR, (ii) développer une interface intuitive pour manipuler les données dans l’espace et dans les propriétés (ex : contraste, transparence), (iii) créer un outil de segmentation par mouvement combiné à une procédure d’inférence amortie permettant une segmentation en direct des données, et (iv) une interface post-traitement pour corriger les anomalies et fournir divers résultats de sortie.

Hommage à Maxime Dahan