L’objectif de cette thèse est de concevoir et valider des algorithmes permettant de détecter de façon quantitative des signaux bioluminescents simultanément sur plusieurs souris non anesthésiées. Ce projet de thèse s’articule autour de trois axes :
Il sera nécessaire de combiner une technique de profilométrie permettant d’extraire l’information quantitative du signal indépendamment de la position de l’animal avec une technique d’acquisition d’imagerie des animaux libres en mouvement. Pour cela, nous développerons des algorithmes qui s’appuieront sur les données issues de la profilométrie dynamique, sur une modélisation de la souris basée sur les modèles physiques, et sur la mise en correspondance de l’image optique et de l’image infrarouge par Machine Learning pour suivre les variations temporelles de l’émission BLI. Ce travail permettra de renforcer le positionnement leader de Biospace Lab dans le marché compétitif de l’imagerie optique en temps réel du petit animal.
Institut Pasteur