ENCOMPASS – Evaluation de méthodes de comptage neuronal pour des études précliniques

L’objectif du projet de recherche ENCOMPASS est d’évaluer quantitativement la performance de plusieurs méthodes de comptage neuronal basées sur des techniques avancées de traitement d’images avec méthode de stéréologie de référence (dissecteur optique).

Tirant parti des dernières avancées en matière d’apprentissage machine et de calcul haute performance (HPC), un environnement logiciel complet sera développé pour réaliser ces investigations à grande échelle. Après la détection des neurones individualisés, une modélisation de leur organisation sous la forme d’un réseau sera étudiée afin d’explorer de nouvelles approches pour effectuer des segmentations anatomiques et identifier de nouveaux biomarqueurs de la mort neuronale.

L’objectif de l’application biologique ciblée sera d’étudier pour la première fois le nombre de neurones dans un modèle de PSN d’infection à VIH et de sida. Cette étude exploratoire comprendra le traitement de 15 hémibrains macaques pour lesquels des séries de coupes histologiques seront produites dans tout le cerveau.

Un transfert de technologie de ces développements logiciels à un partenaire industriel sera envisagé à la fin du projet.