Microscopy with Deep Learning – Amélioration de la microscopie super-résolutive grâce à l’apprentissage profond

– Appel à projets 2019 : Paris Région PhD² –
  • Analyse d'images
  • Cellule unique/molécule unique
Christophe Zimmer

AMCervUS – Apprentissage Machine appliqué à l’échographie ultrarapide pour la caractérisation vasculaire et fonctionnelle du Cerveau

– Appel à projets 2019 : Paris Région PhD² –
  • Analyse d'images
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Mickaël Tanter

CartoBrain – Cartographie haute résolution des réseaux de neurones par microscopie optique en recherche préclinique

– Appel à projets 2019 : Paris Région PhD² –
  • Analyse d'images
  • Cellule unique/molécule unique
Thierry Delzescaux

MECAFM – In situ AFM for probing tissue and cell mechanics in controlled microenvironment

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
  • Cellule unique/molécule unique
Benoit Ladoux , Rene-Marc Mege, Delphine Delacour, Nicolas Minc

O P I Oblique-Plane Imaging for optical sectioning and fast volumetric imaging. Studying the cell nucleus in whole with molecular resolution

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Cellule unique/molécule unique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Ignacio Izzedin, Antoine Coulon

3BIOT 3D Biological Optical Tweezers

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Cellule unique/molécule unique
Sinan Haliyo, Thierry Rose, Jean-Baptiste Manneville

SYNALGIA – Coupling of microfluidic lab-on-chip to ion-mobility mass spectrometry for Parkinson disease biomarker validation

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Microfluidique
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Frédéric Halgand, Antoine Pallandre

CystEar – Development of a scalable method to generate stem cell-derived inner ear organoids

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Samy Gobaa, Raphael Etournay

ULTRASTIM – Large scale stimulation and imaging of neuronal ensembles at single cell resolution using acousto-optic methods

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Stéphane Dieudonné, Brice Bathellier

3‐DiPSI Wavefront imaging for 3D stabilization and superresolution

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies performantes et à bas coût
Pascal Berto, Audrey Salles, Elric Esposito, Cécile Leduc, Hilde de Reuse, Nathalie Sauvonnet, Chiara Zurzolo

StemCellTrack Microfluidic Platform for Neurosphere Culture and Quantitative Analysis

– Soutien aux équipements pour le développement de technologies innovantes en sciences de la vie –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Charles Baroud, Sébastien Sart

MetaboNIMS – Optimisation de la spectrométrie de masse par MALDI-ToF pour l’analyse de métabolites de coraux

– Appel à projets 2019 : Codéveloppement de technologies et de méthodes innovantes –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Alain Paris, Yong Chen

Développement d’un nouvel modèle d’intestin sur puce réplicant la structure et la dynamique de l’intestin

– Appel à projets 2019 : Codéveloppement de technologies et de méthodes innovantes –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Stéphanie Descroix, Danijela Vignjevic

Fast2P – Une plate-forme d’imagerie deux photons à nappe de lumière, rapide et à grand champ, pour l’imagerie fonctionnelle et anatomique

– Appel à projets 2019 : Mutualisation de nouvelles technologies ou méthodes pour de nouvelles applications en Sciences de la Vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Analyse d'images
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Volker Bormuth, Georges Debrégeas, Raphaël Candelier, Nicolas Renier, Pascal Legendre, Jean-Marie Mangin, Nicolas Michalski , Alain Chedotal

ModLoc : Modulated localization microscopy

– Appel à projets 2019 : Codéveloppement de technologies et de méthodes innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Cellule unique/molécule unique
Emmanuel Fort, Christian Poüs

The SPHeroid Image aNalysis toolboX (SPHINX)

– Appel à projets 2019 : Mutualisation de nouvelles technologies ou méthodes pour de nouvelles applications en Sciences de la Vie –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Jean-Christophe Olivo-Marin, Charles Baroud, Elaine Del Nery, Philippe Bousso

Evaluation of Neuronal COunting Methods in PreclinicAl StudieS (ENCOMPASS)

– Appel à projets 2019 : Codéveloppement de technologies et de méthodes innovantes –
  • Analyse d'images
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Thierry Delzescaux, Delphine Desjardins, Claire Paquet

IMAChip

– Appel à projets 2019 : Mutualisation de nouvelles technologies ou méthodes pour de nouvelles applications en Sciences de la Vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies performantes et à bas coût
Hamed Merdji, Pablo Radicella, Anna Campalans, Laure Bally-Cuif, Nicolas Dray, Franck Chauvat, François Treussart, Christelle Langevin

A STimulated Emission Depletion (STED) microscope for 4D live nanoscopy

– Appel à projets 2019 : Mutualisation de nouvelles technologies ou méthodes pour de nouvelles applications en Sciences de la Vie –
  • Biophotonique et ondes
  • Cellule unique/molécule unique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Gael Moneron, Jost Enninga, Philippe Bastin, David Digregorio, Laurence Cathala, Nathalie Aulner

KaryoDrop

– Appel à projets 2019 : Codéveloppement de technologies et de méthodes innovantes –
  • Microfluidique
  • Cellule unique/molécule unique
Jean Baudry, Patrizia Paterlini Bréchot

Memorable

– Appel à projets 2018 : Soutien équipement –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Ayako Yamada, Jean-Michel Peyrin

HoloCal

– Appel à projets 2018 : Soutien équipement –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Nicolas Renier, Nelson Rebola, Alberto Bacci, Valentina Emiliani, Brice Bathellier, Jérémie Barral, Nicolas Michalski

Re-RAMP-3

– Appel à projets 2018 : Soutien équipement –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Laurent Bourdieu, Stéphane Dieudonné, Clément Léna, Daniela Popa, Sonia Garel

EVortex

– Appel à projets 2018 : Soutien équipement –
  • Microfluidique
  • Technologies performantes et à bas coût
Amanda K. A. Silva, Gabriel Rahmi

AVIRON – Inférence amortie et réalité virtuelle pour segmenter de grands volumes de données neuronales

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Analyse d'images
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Jean-Baptiste Masson, Pierre-Marie Lledo, Maxime Dahan †

AutoStemLab – Différenciation automatisée des cellules souches pluripotentes humaines induites et modèles de laboratoire sur puce

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Microfluidique
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Organes sur puces
Yong Chen, Onnik Agbulut

INFLUERE IN VISCERA – Couplage de la microscopie interférométrique et d’un canal de micrscopie à fluorescence

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Claude Boccara, Marianne De Paepe, Harry Sokol

Système intégré à l’échelle de la cellule unique pour l’étude des mutations et de l’évolution

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Analyse d'images
  • Microfluidique
  • Cellule unique/molécule unique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Lydia Robert, Marina Elez

Développement d’un flux de travail reproductible et multi-échelle en microscopie à lumière corrélative pour suivre des exosomes individuels in vivo

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Analyse d'images
  • Cellule unique/molécule unique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Guillaume van Niel , Graça Raposo, Jean Salamero

Nouvelle technologie microfluidique pour l’analyse multiparamétrique de l’hétérogénéité dans le compartiment myéloïde de certains cancers

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Microfluidique
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Cellule unique/molécule unique
Sebastian Amigoren, Emanuela Romano, Andrew Griffiths

Imagerie dynamique, volumétrique et à super-résolution de l’organisation cellulaire et de l’orientation moléculaire avec la technologie de cryo-arrêt réversible

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Cellule unique/molécule unique
Bassam Hajj, Guillaume Orsi

Plateforme ouverte pour la culture cellulaire 3D dans des dispositifs microfluidiques

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Charles Baroud, Christophe d'Enfert, Nathalie Sauvonnet, Philippe Sansonetti, Philiipe Bousso, Eleine Del Nery, Rachel Golub, Ana Cumano

Une plateforme microfluidique pour le phénotypage automatisé complet du développement post-embryonnaire de C. elegans à résolution cellulaire

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Analyse d'images
  • Microfluidique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Wolfgang Keil, Julie Plastino

MiB2Bplatelet – Augmenter l’échelle de production de plaquettes par un procédé fondé sur la microfluidique:

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Microfluidique
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Mathilde Reyssat, Isabelle Dusanter

Un microscope quantitatif à nappe de lumière en réseau pour l’imagerie de molécules dans l’embryon à haute résolution spatiotemporelle

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Cellule unique/molécule unique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Thomas Gregor, François Spitz

Une plateforme technologique pour étudier le rôle des dommages de l’ADN dans l’épuisement des lymphocytes T

– Appel à projets 2018 : Technologies innovantes –
  • Analyse d'images
  • Cellule unique/molécule unique
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Felice Alessio Bava , Sebastian Amigorena

Développement d’un spectromètre à résonance paramagnétique électronique, pulsé à puissance élevée et hautement sensible, optimisé pour la biologie structurale intracellulaire

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Sun Un, Christian Specht, Shixin Ye

Development of novel optical tools to investigate ensemble dynamics of large-scale neural populations within freely behaving rodents

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Cathie Ventalon, Michaël Zugaro

Plantuidics – A microfabrication unit for the versatile design of microfluidic platforms for plant cell and developmental biology

– Appel à projets 2017 : Soutien équipement –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Sébastien Thomine, Avin Babataheri, David Bouchez, Béatrice Satiat-Jeunemaitre, Samantha Vernhettes, Jean Colcombet, Jean-Christophe Palauqui

Echographie multimodale préclinique pour étudier le développement de la connectivité cérébrale

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Mickael Tanter, Thomas Bourgeron

LN2 – Nouvelles approches pour la microscopie à super-résolution

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies performantes et à bas coût
  • Cellule unique/molécule unique
Bruno Robert, Olivier Espeli

Utilisation de la lithographie sans masque pour de la microfabrication rapide

– Appel à projets 2017 : Soutien équipement –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
  • Cellule unique/molécule unique
Guillaume Laffite, Jean-Louis Viovy, Jacques Fattaccioli, Pascal Silberzan, Philippe Nghe, Matthieu Piel, Maxime Dahan †

MAGDIAG – Détection d’objets biologiques uniques par des nanoparticules magnétiques

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Microfluidique
  • Technologies performantes et à bas coût
Guenaëlle Jasmin Lebras, Stéphanie Simon

Nouveau dispositif microfluidique d’organe sur puce fondé sur des couches d’hydrogel souples et biocompatibles

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Samy Gobaa, Nathalie Sauvonnet

DropPath – Dispositif de séquençage de la cellule unique fondé sur les gouttelettes pour l’étude d’agents pathogènes

– Appel à projets 2017 : Soutien équipement –
  • Microfluidique
  • Cellule unique/molécule unique
Andrew Griffiths, Didier Mazel, Jost Enninga, Philippe Bastin, Nadia Naffakh, Philippe Sansonetti and Nathalie Sauvonnet, Lisa Chakrabarti

STEMCut

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Technologies pour l'étude in vivo de modèles animaux
Emmanuel Beaurepaire, Laure Bally-Cuif

MACS – Manipulation Acoustique de Cellules Souches

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Microfluidique
  • Organes sur puces
Jérôme Larghero, Jean-Luc Aider

3D-MORPHOSTAT – L’architecture moléculaire révélée à l’échelle du nm par imagerie 3D multi-couleur super-résolutive et analyse spatiale orientée objet

– Appel à projets 2017 : Technologies innovantes –
  • Biophotonique et ondes
  • Analyse d'images
  • Cellule unique/molécule unique
Jean-Christophe Olivo-Marin, Lydia Danglot